Попробуйте для начала сделать проще: зайти в режим командной строки при запуске компьютера и запустить утилитку CHKDSK.
Сейчас не помню на вскидку ее ключи, набери chkdsk -? - он покажет тебе все варианты - делай проверку сначала без проверки на бэды, но с исправлением. Если не поможет - прогонись на бэд сектора.

А вообще - для начала - просто скачай с сайта касперского или dr.вэба бесплатную весрию антивируса по запросу, на подобии CureIt, и чекнись на вирусню.