Denvir
Ну про то что NTFS проигрывает FAT'у я бы поспорил. NTFS по надежности ГОРАЗДО лучше, еще преемущество NTFS это отсутстивие так называемой "таблицы размещения файлов", из-за которой иногда пропадает инфа на винте. А вот какую ФС пользовать каждый решает сам ибо на домашней машине незачем такой уровень защиты как на рабочей станции.
ЗЫ. Основной недостаток NTFS в том что для чтения диска с этой ФС под досом или виндой ниже 2000 необходим спецсофт.

Это кратко, а вобще есть еще Хелп в мастдае там все написано.