По новым правилам регистрации тс, двигатель не считается номерным агрегатом, ему дано понятие запчасть, номер не регистрируется в регистрационных документах. В правилах указано что должна совподать модель двигателя только. Документы на двигатель не нужны, главное модель. На осмотре смотрят только модель двигателя и тип, если докапываются до номера двигателя, то это превышение полномочий. Сейчас выдают новые ПТС и СТС, в них даже строки нет про двигатель.
Соответственно автору темы нужно только оплатить госпошлину за замену ПТС и СТС.